Auch die natürliche Menstruation ist im Prinzip eine Hormonentzugsblutung. Ist keine Schwangerschaft eingetreten, stellt am Ende des Zyklus der Gelbkörper seine Funktion ein und es wird kein Progesteron mehr herstellt. Durch den Abfall der Progesteronspiegel kommt es zur Blutung. Im Gegensatz zur Blutung während der Einnahmepause der Pille, die rein „künstlich" ist, zeigen regelmäßige Menstruationsblutungen an, dass die Frau gesund ist und dass ihr Zyklus funktioniert. Sehr unregelmäßige Menstruationen können ein Hinweis darauf sein, dass das Zusammenspiel der Hormone gestört ist.