Besteht Verdacht auf Endometriose, erfolgt zunächst eine eingehende Befragung und eine gynäkologische Untersuchung. Sind nur kleine Endometrioseherde vorhanden, so wird die Tastuntersuchung meist noch keine Hinweise erbringen. Im Anschluss wird dann eine Ultraschalluntersuchung durchgeführt. Diese Untersuchung kann zwar eine Endometriose auch nicht endgültig bestätigen, es ist jedoch möglich, zystische Veränderungen, die ähnliche Beschwerden hervorrufen können, zu entdecken und deren Größe und Lage genau zu bestimmen. Eine sichere Unterscheidung zwischen Zysten und Endometrioseherden ist allerdings nicht möglich. Diese kann nur im Rahmen einer Bauchspiegelung vorgenommen werden. Dabei wird in Vollnarkose über einen sehr feinen, kleinen Schnitt am Bauchnabel ein Endoskop eingeführt - mit diesem Gerät kann gewissermaßen in den Bauchraum hineingesehen werden. Verdächtige Herde können im Zuge der Bauchspiegelung sofort entfernt und dann mikroskopisch untersucht werden. Erst durch die Untersuchung der Gewebeprobe kann die Diagnose eindeutig gestellt werden.