Einzig wirksamer Schutz ist „Safer Sex" mit konsequenter Anwendung von Kondomen.

Haupt-Risikogruppe für urogenitale Chlamydien-Infektionen sind sexuell aktive junge Frauen. Ihr Wissen über die Folgen einer Ansteckung ist sehr gering. Hier ist mehr Aufklärung über die Risiken der Krankheit (Unfruchtbarkeit) und die Übertragungswege nötig.

Schutz vor einer chronischen Infektion bietet die rechtzeitige Behandlung. Dazu ist eine frühe Diagnose notwendig. Da die Krankheit oft ohne oder mit leichten Symptomen verläuft, ist dies nur durch einen prophylaktischen Test auf den Erreger möglich. Die Krankenkassen übernehmen solche Tests zur Zeit nur bei Schwangeren und bei tatsächlichem Infektionsverdacht (Bauchschmerzen, Augenentzündungen, Gelenkbeschwerden). Alle, die sich sonst testen lassen wollen, müssen die Untersuchung selbst bezahlen.

Eine Schwimmbad-Konjunktivitis lässt sich nur durch den Verzicht auf den Besuch von Schwimmbädern oder ausreichende Chlorung des Badewassers vermeiden.