Besondere Beachtung verdient die bakterielle Vaginose während der Schwangerschaft, da ein signifikanter Zusammenhang zu vorzeitigen Wehen, einem vorzeitigem Fruchtblasensprung und einer Frühgeburt besteht. Die Ursache hierfür sind verschiedene biochemische Reaktionen zwischen Fötus und Gebärmutter, die durch die bakterielle Fehlkolonisation ausgelöst werden. Im Ergebnis kommt es zu einem verstärkten Aufbau von Prostaglandin. Prostaglandin wird beispielsweise als Medikament in der Geburtsmedizin eingesetzt, um Wehen auszulösen und eine Geburt einzuleiten.  

Als weitere Komplikationen sind bekannt:

• Amnionitis (Infektion der Embryonalhülle während der Schwangerschaft)
• Bauchdeckenabzess nach einem Kaiserschnitt
• verzögerter Heilungsprozess eines Damm-Schnitts bei der Entbindung
• Endometritis nach der Entbindung
• weitere peripartale und perinatale Infektionen